Công đoàn Đại học Đà Nẵng được thành lập theo Quyết định số 91/QĐ-CĐ ngày 18/08/1995 của Liên đoàn Lao động Quảng Nam - Đà Nẵng. Hiện nay, Công đoàn Đại học Đà Nẵng có 08 công đoàn cơ sở trực thuộc gồm: Công đoàn Trường Đại học Bách khoa, Công đoàn Trường Đại học Kinh tế, Công đoàn Trường Đại học Sư phạm, Công đoàn Trường Đại học Ngoại ngữ, Công đoàn Trường Đại học Sư phạm Kỹ thuật, Công đoàn Trường Đại học Công nghệ Thông tin và Truyền thông Việt - Hàn, Công đoàn Cơ quan Đại học Đà Nẵng, Công đoàn Phân hiệu Đại học Đà Nẵng tại Kon Tum. Công đoàn Đại học Đà Nẵng chịu sự lãnh đạo, chỉ đạo của Công đoàn Giáo dục Việt Nam và Đảng ủy Đại học Đà Nẵng.

Công đoàn Đại học Đà Nẵng có nhiệm vụ và quyền hạn: Tuyên truyền đường lối, chủ trương của Đảng, chính sách, pháp luật của Nhà nước; triển khai thực hiện các chỉ thị, nghị quyết và chủ trương công tác của công đoàn cấp trên; chỉ thị, nghị quyết của cấp ủy đảng và nghị quyết đại hội công đoàn cấp mình; tham gia với cấp ủy đảng, lãnh đạo chuyên môn về công tác quản lý, lãnh đạo cơ quan về các vấn đề có liên quan đến quyền và lợi ích hợp pháp chính đáng của người lao động.

Phối hợp với thủ trưởng cơ quan thực hiện quy chế dân chủ, tổ chức hội nghị cán bộ công chức cơ quan; kiểm tra, giám sát việc thực hiện các chế độ, chính sách, giải quyết khiếu nại, tố cáo đối với các cơ sở trực thuộc cơ quan.

Tổ chức phong trào thi đua yêu nước trong đoàn viên, CNVCLĐ, góp phần hoàn thành tốt nhiệm vụ của cơ quan, đơn vị; vận động đoàn viên và người lao động tham gia xây dựng Đảng, chính quyền trong sạch, vững mạnh và tham gia các hoạt động xã hội; hướng dẫn các hình thức, biện pháp chăm lo đời sống, cải thiện điều kiện làm việc, xây dựng cơ quan văn hóa, tham gia cải cách hành chính, đấu tranh ngăn chặn tiêu cực, tham nhũng, lãng phí và các tệ nạn xã hội.

Phát triển đoàn viên, thành lập và xây dựng công đoàn cơ sở vững mạnh, thực hiện công tác tổ chức cán bộ theo phân cấp của công đoàn ngành trung ương.

Quản lý tài chính, tài sản công đoàn theo quy định của pháp luật.